辣椒苗期抗感黄瓜花叶病毒病比较转录组学分析

摘要

为了研究辣椒在黄瓜花叶病毒侵染下的分子响应机制、发掘抗病相关基因,以感病材料茄门和抗病材料JJ101为对象,对接种黄瓜花叶病毒前后的茄门和JJ101叶片进行高通量转录组测序,并利用生物信息学方法对基因表达和功能进行研究.结果显示,采用RPKM法计算基因表达量,共筛选出JJ101和茄门接种黄瓜花叶病毒后的1158个差异表达基因.其中有643个差异基因在GO(gene ontology)中富集,功能主要涉及酶活性、代谢过程和防御反应等.有287个差异基因归入KEGG通路,在这些通路中,包括植物-病原互作、植物激素信号传导等过程.研究发现,辣椒对黄瓜花叶病毒的免疫是一个极其复杂、多个通路共同调节的过程,蛋白质代谢、防御反应、激素调节等通路均参与其中,为后续深入研究辣椒抗病分子机理奠定了理论基础.