基于16S rDNA测序的帕金森病患者肠道菌群初步分析

摘要

cqvip:目的对帕金森病患者的肠道菌群进行初步分析.方法收集2018年10月~2019年4月某三甲医院收治的7例帕金森病患者及7例健康对照者的粪便样本,提取菌群DNA,选取细菌16S rDNA的V3 ~V4区序列进行基因扩增及Illumina测序,生物信息学分析肠道菌群测序数据.结果 Alpha多样性分析中,Chao指数、Ace指数、Shannon指数、Simpson指数在两组样本间无显著统计学差异(P>0.05).在界、门分类水平上PD组及健康对照组物种数目相等,在纲、目、科、属、种、OTU分类水平上PD组所包含的物种数目依次高于健康对照组.受试样本中肠道菌群结构由4个主要的菌门组成,分别为厚壁菌门、拟杆菌门、变形菌门和放线菌门.在PD组中,检测到了12种显著升高的肠道菌群组分(P<0.05).结论帕金森病患者与健康对照者的肠道菌群结构在大体上是相似的,有部分菌群在两组间存在着差异,深入分析肠道菌群变化有望为研究帕金森病的发病机制、疾病预防及治疗提供新思路.