细胞免疫基因eater在果蝇中的单倍型结构和表达差异

摘要

Eater蛋白在黑腹果蝇的微生物识别和防御性吞噬中起重要作用。笔者从非洲和北美的D.melanogaster群体中测序比较了eater基因的复等位基因,并在北美eater基因的第2外显子处发现了小范围的局部选择性清除。此模式与基因为适应非洲以外的新的选择压力所发生的改变相一致。北美的样本被分为2个优势单倍型,推荐的单倍型有较高的基因表达水平,提示该基因的调控可能是选择的目标。eater基因包含22~40个拷贝（重复单元）,这些拷贝（重复单元）以拥有一个富含半胱氨酸的NIM模式为主要特征。由于NIM重复位于一个重复排列区,其在蛋白质结构中展示了协同进化的作用。eater基因预先拥有几个NIM重复,以便与微生物的配体结合,此功能可能是让NIM重复优先根据服从于特别进化压力进行进化。然而,在这些病原互作体中没有发现能提高正向选择的证据。本研究为基因表达而非蛋白质结构促进免疫系统中病原分子识别模式的适应性进化提供了实例。