一株Class Ⅰ新城疫病毒中国分离株分子特性的研究

摘要

对从健康家鸭中分离到的一株Class Ⅰ新城疫病毒分离株Duck～China～08-004～2008进行了遗传进化特性研究.利用RT-PCR扩增了该分离株F基因的主要功能区片段,并进行了克隆与序列分析.序列测定结果已经登录到GenBank,登录号为EU589149.该分离株F蛋白裂解位点的组成为112E-Q-Q-E-R-L117.具有典型新城疫弱毒株的分子特征.同源性分析表明其与国内普遍使用的弱毒疫苗株LaSota和V4核苷酸的同源性较低(分别为55.4%和57.7%).通过构建F基因的遗传进化树,结果表明该分离株在分类地位上属于Class Ⅰ,与我国目前普遍使用的弱毒疫苗株LaSota(Class Ⅱ中的基因Ⅱ型)和V4(Class Ⅱ中的基因你Ⅰ型)处在不同的进化分支.通过构建57株class Ⅰ新城疫病毒的遗传进化树,表明本分离株与近年来香港活禽市场分离株较为类似,同属于基因3型.