基于16SRNA序列的哺乳仔猪和断奶仔猪回肠微生物多样性分析

摘要

定居在仔猪小肠（特别是回肠）的微生物群落对保持宿主健康非常重要。为了解断奶应激对仔猪肠道微生物群落的影响，对16SRNA进行测序，用DOTUR软件分析了21日龄和28日龄哺乳仔猪以及28日龄断奶仔猪的回肠微生物群落的多样性。结果表明，仔猪回肠微生物群落主要由革兰氏阳性菌组成；分别从21日龄哺乳仔猪、28日龄哺乳仔猪和28日龄断奶仔猪回肠食糜中获得171个（40个分类单元）、194个（61个分类单元）和171个（56个分类单元）克隆；21日龄哺乳仔猪回肠中，主要是乳酸杆菌属细菌（87．7％），其次是链球菌属细菌（3．5％），其中在乳酸杆菌属中，食淀粉乳杆菌（Lactobacillusamylovorus）、乳酸乳杆菌（Lactobacillussp．）、罗伊氏乳杆菌（Lactobacillusreuteri）、唾液乳杆菌（Lacto—bacillussalivarius）和粘膜乳杆菌（Lactobacillus，）分别占51．5％、19．3％、12．3％、9．4％和4．7％；在28日龄哺乳仔猪回肠中，乳酸杆菌属细菌比例降低为71．1％，链球菌属细菌比例迅速升高至21．1％；在28日龄断奶仔猪回肠中，乳酸杆菌属和链球菌属细菌依然最多，分别占52．0％和26．3％，其中在乳酸杆菌属中，食淀粉乳杆菌（31．6％）和罗伊氏乳杆菌（16．4％）是最多的2个种。因此，哺乳仔猪和断奶仔猪回肠的微生物群落多样性无显著差异，但微生物群落构成有显著变化。这有利于充分了解断奶对仔猪回肠微生物群落的影响，便于运用某些营养学手段减弱断奶对仔猪的影响。