沉积物中宏基因组DNA快速提取方法:重铬酸钾-SDS法（英文）

摘要

[目的]建立一种从黑臭沉积物中快速、不需要任何纯化步骤的基因组DNA提取方法。[方法]富营养化湖泊沉积物是一种复杂的生态系统,土壤微生物在其氮循环过程中起着重要的作用。基于DNA的分子生物学方法为描述这些复杂微生物群落提供了新途径。但是,很难去除基因组DNA(代表了这些复杂系统中的微生物群落)的共提取物腐殖酸、重金属等物质,其能够干扰后续的基因分析。[结果]腐殖酸去除和DNA提取同步进行,提取时间大约为1 h,所得到的核酸不需要用70%的乙醇洗,直接溶解于灭菌水即可用于总细菌16S r DNA、反硝化细菌nos Z基因、甲烷氧化菌pmo A基因、固氮细菌nif H基因、氨氧化细菌和古菌的amo A基因的分子生态学分析。[结论 ]该方法为快速制备沉积物DNA提供了一个框架。