西洋参cDNA文库构建及表达序列标签(EST)分析

摘要

为研究西洋参根的基因表达谱和挖掘其功能基因, 采用表达序列标签(EST)技术首次建立了四年生西洋参根的EST文库.通过BLAST与Gene Ontology分析获得与人参皂苷生物合成相关、编码P450和糖基转移酶等的基因序列11个, 与生长素调节生长发育相关、 编码生长素响应因子4和生长素调节蛋白等的基因6个, 与水分胁迫相关、编码蛋白dehydrin和DC2.15 like蛋白等的基因7个, 与编码抗氧化酶如peroxidase和catalase相关的基因6个.另外, 从西洋参根的EST文库获得抗病基因12个, 分别编码转录因子WRKY家族蛋白和ribonuclease蛋白家族, 62个EST是其他物种尚未报道的新基因.可见, EST技术作为功能基因组研究的重要手段可在西洋参功能基因的开发与研究中发挥重要作用, 这些基因的发现为进一步克隆基因全长、研究基因功能、 改良西洋参品质、阐明西洋参生长缓慢的分子机制等方面奠定了基础.