不同能源条件下中度嗜热嗜酸细菌多样性分析

摘要

采用黄铁矿、黄铜矿、硫酸亚铁和硫粉混合物作为主要能源物质在50℃条件下分别培养中度嗜热细菌混合物,研究其细菌多样性.提取细菌基因组总DNA,采用PCR结合限制性酶切片段多态性分析(RFLP)方法进行细菌16S rRNA基因的系统发育分析,比较不同能源条件下富集培养的混合细菌群落构成的差异.从3个培养物中共获得阳性克隆303个并进行RFLP分析,对29种不同酶切谱型的克隆插入序列进行测定和系统发育分析.大部分序列与已报道的浸矿微生物16S rRNA序列相似性较高(89.1%～99.7%),归属于硫化叶菌属的耐温氧化硫化杆菌(Sulfobacillus thermotolerans)和热氧化硫化杆菌(Sulfobacillus thermosulfidooxidans),嗜酸硫杆菌属的喜温硫杆菌(Acidithiobacillus caldus),钩端螺旋菌属的嗜铁钩端螺旋菌(Leptospirillum ferriphilum)以及uncultured forest soil bacterium、uncultured proteobacterium.其中Acidithiobacillus caldus,Sulfobacillus thermotolerans,Leptospirillum ferriphilum 3种细菌为三类能源物质培养物中的优势细菌类群.L.ferriphilum在黄铁矿培养体系(53.8%)和硫酸亚铁和硫粉为能源的培养体系中(45.9%)中丰度最高;在以黄铜矿为能源物质的培养体系中,S.thermotolerans的比例大幅上升(70.1%).