大西洋洋中脊深海多环芳烃降解菌群的优势菌分析

摘要

【目的】为了分析大西洋洋中脊深海海水及表层沉积物中多环芳烃(PAHs)降解菌群中的优势菌。【方法】采用富集培养法和平板涂布法从深海样品中分离可培养细菌及PAHs降解菌。通过16S rRNA基因测序完成系统发育分析。采用变性梯度凝胶电泳(DGGE)及DNA测序分析降解菌群中的优势菌。【结果】总共分离到16株细菌,包括一株PAHs降解菌Novosphingobium sp.4D。系统发育分析发现,可培养细菌中两个最大的类群分别与Alcanivorax dieselolei NO1A(5/16)和Tistrella mobilis TISTR1108T(5/16)亲缘关系最近。DGGE结果表明,在菌群MC2D中菌株4L(以及4M、4N,Alcanivorax dieseloleiNO1A,99.21%)、4D(Novosphingobium pentaromativorans US6-1T,97.07%)和4B(以及4E、4H、4K,Tistrella mobilisTISTR1108T,>99%)是降解菌群中的优势菌。而降解菌群MC3CO中的优势菌是菌株5C(以及5H,Alcanivorax dieselolei NO1A,>99%)、条带5-8代表的未培养菌株(Novosphingobium aromaticivorans DSM12444T,99.41%)、5J(Tistrella mobilisTISTR 1108T,99.52%)和5F(以及5G,Thalassospira lucentensis DSM14000T,<97%)。【结论】本研究发现在大西洋洋中脊深海海水及表层沉积物中Alcanivorax、Novosphingobium、Thalassospira、Tistrella属的细菌是PAHs降解菌群中的优势菌,其中的主要降解菌是Novosphingobium属的细菌。