感染GCRV的草鱼miRNA测序与比较分析

摘要

为探索基于高通量筛选抗性主效miRNA功能分子的方法应用于抗性草鱼(Ctenopharyngodon idellus)的选育,研究借助高通量测序鉴定分析感染GCRV前后的草鱼头肾组织中miRNAs。测序结果共鉴定出821个成熟miRNAs,其中118个在GCRV攻毒组特异表达,82个为未攻毒组特有;差异分析结果显示,GCRV处理后有88个miRNA显著下调表达、46个miRNA显著上调表达;qPCR结果显示miR-21在GCRV感染组中的头肾中表达量最高,miR-194a在两个比较组中的差异倍数最大,达到48倍之高;组织表达结果发现部分差异表达miRNA在脾脏、肾脏、头肾、皮肤和鳃等免疫相关器官中高表达;这些结果提示不同的miRNAs在草鱼的GCRV应答过程中发挥着不同的功能,为抗病草鱼的选育提供可参考的分子资源。