中国美利奴羊OAR1脱毛症的基因组选择分析

摘要

绵羊脱毛症受环境和基因的因素共同决定,在分子育种日益盛行的时代,筛选脱毛症相关分子标记,可为绵羊的健康养殖提供参考数据。采取100只健康中国美利奴羊为对照组和50只脱毛症中国美利奴羊为病例组,提取其DNA,制备基因组芯片,采用PLINK软件质量控制以提取OAR1(Ovis aries 1绵羊1号染色体),通过Vcftools对所获得的数据进行遗传分化系数(F_(st))计算,从大到小选择总数值的前1%。结果表明:经过质量控制后,获得相关SNPs为4958个;F_(st)计算后获得分子标记35个,经过基因注释获得53个,其中影响皮肤发育的基因有GADD45A、MCCC1、MLPH、SSBP3等,已经有文献报道SSBP3与脱毛症相关。对获得的分子标记可以为绵羊分子选育提供参考,缩短世代间隔,提高育种年限,节约成本,最终获得免疫力强的健康绵羊,防止绵羊脱毛症的出现,从而减少农牧民的经济损失。