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第一部分:碰撞诱导解离和高能碰撞解离方式进行蛋白质组学分析的比较;第二部分:新疆维吾尔族与汉族IgA肾病的尿液差异蛋白质组学分析

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目录

英文缩略词

第一部分 碰撞诱导解离和高能碰撞解离方式进行蛋白质组学分析的比较

摘要

第一章 引言

第二章 材料与方法

一.实验材料

二.实验方法

第三章 实验结果

一.简单样品酶解产物的分析比较

二.复杂细胞样品酶解产物的分析比较

第四章 讨论

第五章 结论

参考文献

第二部分 新疆维吾尔族与汉族IgA肾病的尿液差异蛋白质组学分析

摘要

第一章 引言

第二章 材料与方法

一.实验材料

二.实验方法

第三章 实验结果

一.临床资料分析

二.蛋白鉴定与定量

三.GO分析

四.IPA蛋白质功能分析

五.Western Blot分析

第四章 讨论

IgAN疾病共性研究

民族差异研究

差异蛋白质分子分析

第五章 结论

参考文献

附表

综述 IgA肾病的尿液蛋白质组学研究进展

致谢

个人简历

声明

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摘要

目的:
  比较碰撞诱导解离(collision induced dissociation,CID)和高能碰撞解离(high energy collision dissociation,HCD)两种离子裂解方式在蛋白质组学分析方面的差异。
  方法:
  以牛血清白蛋白和细胞裂解物为研究对象,分别应用碰撞诱导解离(CID)和高能碰撞解离(HCD)两种离子裂解方式对样品进行分析,比较所鉴定到的多肽和蛋白数目,确定两种离子裂解方式在蛋白质组学分析方面的差异。
  结果:
  在简单样品牛血清白蛋白中,HCD碎裂方式所得的谱图匹配率和多肽Mascot得分较高,表明其质谱图质量较高。在复杂样品细胞裂解物中,CID碎裂方式鉴定到的谱图数、多肽数和蛋白数目较多,表明该方式灵敏度较高;HCD碎裂方式所得质谱图匹配率较高、Mascot得分较高,表明其质谱图质量较好。
  结论:
  这两种方式均可用于大规模蛋白质组学分析,CID方式可以提供更高的灵敏度,HCD方式可以获得更高质量的质谱谱图。

著录项

  • 作者

    王曌;

  • 作者单位

    北京协和医学院;

    中国医学科学院;

    清华大学医学部;

    北京协和医学院中国医学科学院;

  • 授予单位 北京协和医学院;中国医学科学院;清华大学医学部;北京协和医学院中国医学科学院;
  • 学科 药学
  • 授予学位 硕士
  • 导师姓名 孙伟;
  • 年度 2016
  • 页码
  • 总页数
  • 原文格式 PDF
  • 正文语种 中文
  • 中图分类 蛋白质;
  • 关键词

    蛋白质组学; 离子裂解方式; 新疆维吾尔族; 汉族; IgA肾病; 尿液差异;

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