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核酸修复酶操纵的DNA纳米技术在基因检测及成像中的应用

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摘要

1.1.1碱基切除修复概述

1.1.2碱基切除修复步骤

1.1.3碱基切除修复与癌症

1.2 DNA纳米技术

1.2.1 DNA纳米技术概述

1.2.2 DNA纳米技术应用

1.3 核酸修复酶检测方法

1.3.1常规检测方法

1.3.2核酸荧光杂交探针法

1.4单核苷酸基因突变检测与基因原位成像

1.4.1 基于核酸杂交探针的单核苷酸基因突变检测方法

1.4.2基于核酸杂交探针的基因原位成像

1.5本论文工作

1.5.1 选题意义

1.5.2研究内容

第2章细胞内源性驱动力核酸修复酶APE1启发的DNA纳米机器

2.1 引言

2.2 实验原理

2.3 实验部分

2.3.1主要仪器

2.3.2主要试剂及材料

2.3.3 DNA纳米机器的设计及合成

2.3.4凝胶电泳技术对DNA纳米机器的表征

2.3.5核酸荧光探针法对DNA纳米机器移动速度的表征

2.3.6单分子荧光显微技术实时监控DNA纳米机器的移动

2.3.7活细胞中操纵DNA纳米机器

2.4.1 原理验证

2.4.2 DNA纳米机器的移动速度

2.4.3 DNA纳米机器的实时监控

2.4.4活细胞中DNA纳米机器的操纵

2.5结论

第3章具有可调控细胞内源性放大器的DNA逻辑开关在核酸成像中的应用

3.1 引言

3.2 实验原理

3.3 实验部分

3.3.1主要仪器

3.3.2主要试剂及材料

3.3.3 DNA逻辑开关的设计及合成

3.3.4凝胶电泳技术对DNA逻辑开关的表征

3.3.5体外荧光探针法对miRNA的放大检测

3.3.6活细胞中操纵DNA逻辑开关

3.3.7实时荧光定量PCR检测细胞内miR-21含量

3.4.1原理验证

3.4.2 DNA逻辑开关体外基因信号放大检测

3.4.3 活细胞中操纵DNA逻辑开关进行miRNA的荧光成像

3.4.4调节细胞内置放大器的放大程度

3.5结论

第4章基于核酸修复酶串联反应动力学的基因突变检测方法

4.1 引言

4.2实验原理

4.3 实验部分

4.3.1 主要仪器

4.3.2主要试剂及材料

4.3.3检测目标基因突变

4.3.4利用单分子荧光显微技术表征检测方法

4.3.5细胞系中基因组DNA的提取及BRAF V600E的检测

4.4结果与讨论

4.4.1原理验证

4.4.2全部类型及低丰度单核苷酸突变检测

4.4.3串联反应的单分子水平分析

4.4.4癌细胞系中BRAF c.1799T>A基因突变检测

4.5 结论

第5章基于核酸杂交动力学基因突变单分子计数

5.1 引言

5.2实验原理

5.3 实验部分

5.3.1主要仪器

5.3.2主要试剂及材料

5.3.3 目标基因的单分子计数

5.3.4单分子荧光数据分析

5.3.5癌细胞系中总RNA的提取、逆转录及不对称PCR

5.4结果与讨论

5.4.1原理验证

5.4.2 Gamma分布模型指导的反应条件优化

5.4.3低丰度单碱基突变检测

5.4.4癌细胞系中基因组KRAS c.34G>A及BRAF c.1799T>A基因突变检测

5.5结论

第6章结论与展望

6.1 结论

6.2 展望

参考文献

致谢

发表的学术论文及研究成果

作者和导师简介

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著录项

  • 作者

    李丽丹;

  • 作者单位

    北京化工大学;

  • 授予单位 北京化工大学;
  • 学科 化学工程与技术
  • 授予学位 博士
  • 导师姓名 喻长远;
  • 年度 2020
  • 页码
  • 总页数
  • 原文格式 PDF
  • 正文语种 chi
  • 中图分类 卫生基础科学;
  • 关键词

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