水稻抽穗期等位基因的遗传分化及qHD3基因的多效性分析

目录

声明

1 水稻抽穗期概述

2 水稻抽穗期基因的克隆

2.1抽穗期主基因

2.1.1 水稻开花促进因子OsMADS50

2.1.2 水稻开花调节因子DTH8

2.1.3 水稻开花促进因子Hd1

2.1.4 水稻成花素基因Hd3a

2.1.5 水稻开花调节因子OsDof12

2.1.6 水稻成花素基因RFT1

2.1.7 水稻光周期敏感基因se14

2.1.8 水稻开花负调控因子OsGI

2.2水稻抽穗期数量点位性状QTL

2.2.1 水稻抽穗期QTL的互作及研究进展

2.2.2 水稻抽穗期QTL qHD3

3 水稻开花调控通路

3.1 以Hd1为核心的OsGI-Hd1-Hd3a开花调控通路

3.2 以Ehd1为核心的Ehd1-Hd3a/RFT1开花调控通路

3.3 独立于Hd1和Ehd1调控通路的特异性开花调控因子

4 水稻粒长、千粒重主基因GS3

5 染色体单片段代换系

5.1 染色体单片段代换系在研究中的优势

5.2 染色体单片段代换系的构建

6 高通量测序

6.1 技术应用

6.2 转录组测序

第一章 水稻单片段代换系抽穗期基因等位基因的遗传分化

1 实验材料

2 实验方法

2.1 主要试剂、仪器与设备

2.2 实验材料的种植

2.3 引物设计

2.4 实验步骤

3 实验结果

3.1 田间抽穗调查

3.2 WY18代换片段上抽穗期基因的遗传分化

3.3 WY24代换片段上抽穗期基因的遗传分化

3.4 WY26代换片段上抽穗期基因的遗传分化

3.5 WY70代换片段上抽穗期基因的遗传分化

4 本章结论

第二章 水稻抽穗期QTL qHD3的多效性分析及基因预测

1 实验材料

2 实验方法

2.1 主要试剂、仪器与设备

2.2 实验材料的种植

2.3 转录组测序

2.4 引物设计

2.5 实验步骤

3 实验结果

3.1 转录组测序分析

3.2 水稻抽穗期QTL qHD3的多效性分子机制

3.3 利用RNA-seq预测水稻抽穗期基因

4 本章结论

第三章 讨论

1 实验的创新和优势

2 需要进一步解决的问题

参考文献

附录1 中英文略写词表

附录2 已报道的86个水稻抽穗期基因总汇

附录3 45D-WY70与45D-HJX74的GO富集分析描述

附录4 55D-WY70与55D-HJX74的GO富集分析描述

附录5 70D-WY70与70D-HJX74的GO富集描述

附录6 45D-WY70与45D-HJX74的KEGG Pathway富集描述

附录7 55D-WY70与55D-HJX74的KEGG Pathway富集描述

附录8 70D-WY70与70D-HJX74的KEGG Pathway富集描述

攻读硕士学位期间取得的研究成果

致谢