声明
致谢
摘要
1 生物信息学在棉花NBS抗病基因鉴定及分析中的应用
1．1 文献综述
1．1．1 生物信息学与植物抗病基因组研究
1．1．2 棉花基因组研究
1．1．3 植物抗病基因的作用机制
1．1．4 植物抗病基因的主要结构及其功能
1．1．5 植物抗病基因的产生及进化机制
1．1．6 植物抗病基因的应用
1．1．7 植物抗病基因研究进展
1．2 本研究立题依据及研究内容
1．2．1 立题依据
1．2．2 研究意义
1．2．3 研究内容
1．2．4 技术路线
1．3 材料与方法
1．3．1 棉花基因组数据及其它植物抗病基因来源
1．3．2 棉花基因组NBS类型抗病基因的鉴定
1．3．3 棉花NBS类型抗病基因的分类
1．3．4 棉花NBS类型抗病基因结构分析
1．3．5 棉花NBS类型抗病基因在染色体上的定位
1．3．6 棉花NBS类型抗病基因复制分析
1．3．7 序列比对及进化树构建
1．3．8 抗病基因邻近抗病QTL搜索
1．3．9 抗病基因转录组及EST表达分析
1．3．10 抗病基因的RT-PCR验证
1．3．11 抗病基因分子标记开发
1．4 结果与分析
1．4．1 棉花NBS类型抗病基因的确定
1．4．2 棉花NBS类型抗病基因motif分析
1．4．3 棉花NBS类型抗病基因的分类
1．4．4 棉花NBS类型抗病基因的基因组定位
1．4．5 棉花NBS类型抗病基因的复制
1．4．6 棉花NBS类型抗病基因系统进化树分析
1．4．7 棉花与NBS类型抗病基因毗邻的抗病QTL
1．4．8 棉花NBS类型抗病转录组及EST表达分析
1．4．9 棉花NBS类型抗病基因的RT-PCR表达分析
1．4．10 棉花NBS类型抗病基因分子标记开发
1．5 讨论
1．5．1 棉花NBS抗病基因N端结构变异
1．5．2 棉花非标准NBS抗病基因的产生机制
1．5．3 棉花NBS抗病基因的复制
1．5．4 NBS抗病基因的系统进化
1．5．5 棉花NBS抗病与抗病QTL的关联
1．5．6 本研究对棉花抗病育种的作用
2 玉米穗部性状QTS的检测及分析
2．1 文献综述
2．1．1 基于GWAS的QTS定位
2．1．2 SNP标记概述
2．1．3 玉米穗部性状研究进展
2．1．4 本章研究对象及研究意义
2．2 玉米穗部性状QTS定位材料和方法
2．2．1 QTS定位材料
2．2．2 QTS定位方法
2．2．3 SNP定位
2．3 玉米穗部性状QTS定位结果分析
2．3．1 三种检测方法检测到的QTS位点的区别
2．3．2 QTS在基因组中的分布及遗传效应
2．3．3 玉米穗部性状检测到的QTS位点的比较
2．4 玉米穗部性状QTS遗传效应特点
2．4．1 穗长QTS遗传效应特点
2．4．2 穗粗QTS遗传效应特点
2．4．3 行粒数QTS遗传效应特点
2．5 玉米穗部性状分析结果讨论
参考文献
附录
浙江大学;
