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基于线粒体Cytb和COI序列对柑橘木虱种群系统地理学的研究

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目录

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第1章 前言

1.1 柑橘木虱简介

1.1.1 柑橘木虱的形态特征

1.1.2 柑橘木虱的危害对象

1.1.3 柑橘木虱的种群消长规律及其分布北界

1.1.4 柑橘木虱的防治

1.2 系统地理学研究概况

1.2.1 系统地理学简介

1.2.2 分子系统地理学简介

1.2.3 分子系统地理学研究所用到的分子标记

1.2.4 应用于昆虫中的系统地理学分子标记

1.3 木虱总科系统地理学研究概况

1.3.1 国外木虱分子系统地理学研究情况

1.3.2 国内木虱分子系统地理学研究情况

1.3.3 柑橘木虱分子系统地理学研究情况

1.4 本文的研究目的与意义

1.5 研究内容

第2章 材料与方法

2.1 材料

2.1.1 柑橘木虱样品采集

2.1.2 柑橘木虱样品鉴定

2.2 主要仪器及设备

2.2.1 主要仪器

2.2.2 主要试剂

2.3 实验方法

2.3.1 柑橘木虱基因组DNA提取

2.3.2 两种线粒体基因片段的PCR扩增

2.3.3 目的产物电泳检测

2.3.4 目的产物序列测序

2.4 数据处理

第3章 Cytb分子标记结果与分析

3.1 Cytb分子标记实验结果

3.1.1 Cytb分子标记序列碱基组成和种群遗传多样性

3.1.2 各地区种群的遗传距离

3.1.3 不配对分布曲线分析

3.2 基于Cytb序列的全球柑橘木虱遗传多样性分析

3.2.1 全球Cytb序列碱基组成和种群遗传多样性

3.2.2 Cytb标记系统发育树分析

3.2.3 单倍型网络图

3.3 Cytb标记的种群遗传结构分析

3.3.1 柑橘木虱Cytb标记种群之间的遗传分化

3.3.2 中性检验

3.3.3 全球种群不配对分布曲线

3.3.4 分子方差分析(AMOVA分析)

第4章 COI分子标记结果与分析

4.1 COI分子标记实验结果

4.1.1 COI分子标记序列碱基组成和种群遗传多样性

4.1.2 各地区种群的遗传距离

4.1.3 不配对分布曲线分析

4.2 基于COI序列的全球柑橘木虱遗传多样性分析

4.2.1 全球COI序列碱基组成和种群遗传多样性

4.2.2 COI标记系统发育树分析

4.2.3 单倍型网络图

4.3 COI标记的种群遗传结构分析

4.3.1 柑橘木虱COI标记种群之间的遗传分化

4.3.2 中性检验

4.3.3 不配对分布曲线

4.3.4 分子方差分析(AMOVA分析)

第5章 分析与讨论

5.1 碱基组成与多样性分析

5.2 柑橘木虱系统地理结构

5.2.1 柑橘木虱谱系分析与讨论

5.2.2 柑橘木虱种群遗传结构分析

5.3 影响柑橘木虱遗传结构的因素

5.3.1 自然环境的影响

5.3.2 人类活动对柑橘木虱种群的影响

5.4 柑橘木虱可能的入侵路线

第6章 结论与展望

6.1 主要结论

6.2 研究的不足之处

6.3 展望

致谢

参考文献

攻读学位期间的研究成果

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