舟山群岛四个养殖獐种群遗传多样性和遗传结构的ISSR分析

摘要

獐（Hydropotes inermis）是我国二级重点保护动物，由于其具有较高的食用和药用价值，致使种群受到了严重的威胁。养殖獐成为近年来的一个热点，对养殖条件下獐的遗传特征进行研究，不仅能了解在养殖条件下獐的遗传现状，也可为以后繁殖育种提供理论支持。本文便利用简单重复序列间区(inter-simplesequence repeat，ISSR)分子标记技术，对来自舟山群岛4个獐养殖种群的遗传多样性和遗传结构进行了分析。
　　 在对獐进行ISSR-PCR反应体系优化中，在原有的基础上，发现扩增的循环次数为35个时，得到的产物效果最好，并成功的选择出26条可用于獐遗传学研究的ISSR引物。26条ISSR引物共扩增出286个可分析位点，其中多态性位点为184个，多态位点百分比（PPL）为64.34％。獐物种水平上的Nei's遗传多样性指数(H)为0.210，Shannon's多态信息指数(I)为0.318，各种群的H介于0.157-0.190之间，I在0.228-0.278之间，其遗传多样性较为丰富，这可能与其种源来自野外且养殖时间不久有关。
　　 Structure软件分析结果显示，所有个体根据遗传信息的不同可以被分为4个组群，每个养殖场内的个体基本上都在各自独立的组群中，这与地理区域的划分相似。种群间的遗传分化系数Gst（Gst=1-Hs/Ht）为0.163，AMOVA分析结果与此类似，说明各养殖场獐种群间在遗传上已表现出了一定的差异。同时，为了进一步了解各种群间的遗传关系，我们计算了各种群间的Nei's遗传距离并对其进行UPGMA聚类，结果显示:秀山种群(XS)和舟山种群(ZS)先聚在了一起，其次与岱山种群(DS)相聚，最后和朱家尖种群(ZJJ)相聚。
　　 结合以往的研究结果及各养殖场的地理分布信息，我们认为，舟山獐种群的遗传多样性虽然较为丰富，但已出现较大程度的遗传分化现象。因此，我们建议各养殖场需加强不同岛屿种群间个体的交流，特别是朱家尖种群(ZJJ)与其它种群间的交流。同时，本研究也推广了ISSR分子标记在动物遗传研究中的应用。

目录

摘要

第一章 绪论

1 獐的研究现状

2 獐的饲养繁殖

3 ISSR研究现状

3．1 ISSR标记的基本原理

3．2 ISSR技术要点

3．3 ISSR技术在动物遗传结构研究中的应用

3．4 ISSR分子标记应用展望

第二章 实验材料与方法

1 实验材料

2 舟山群岛概况

3 实验仪器、试剂及其来源

3．1 实验仪器

3．2 实验试剂

4 实验方法

4．1 溶液配制

4．2 肌肉组织DNA提取

4．3 ISSR-PCR反应及引物筛选

4．4 数据统计与分析

第三章 结果与分析

1 DNA提取

2 ISSR-PCR扩增循环次数

3 ISSR引物筛选

4 26条引物在4个种群中的扩增结果

5 4个獐种群的遗传多样性

6 4个獐种群遗传结构分析

7 獐种群间的遗传距离和遗传相似度

第四章 讨论

1 獐种群遗传多样性分析

2 獐种群遗传结构及遗传关系分析

3 獐保护建议

参考文献

致谢

硕士在读期间发表的文章

硕士期间参加的项目

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