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致谢
摘要
略缩语表
1.1玉米的驯化
1.1.1玉米的分类和起源
1.1.2玉米驯化中的受选基因
1.2玉米种子的结构和蛋白组成
1.3玉米醇溶蛋白基因的表达调控
1.3.1转录因子对基因的调控及检测
1.3.2转录因子对玉米醇溶蛋白基因的表达调控
1.4本课题研究的目的、意义及主要内容
1.4.1研究目的和意义
1.4.2本研究的主要内容
第二章玉米低和单拷贝醇溶蛋白基因的进化和遗传多态性
2.1引言
2.2材料和方法
2.2.1植物材料
2.2.2基因克隆和测序
2.2.3序列分析
2.2.4遗传多态性分析和中性进化检验
2.2.5系统发育分析
2.3结果与分析
2.3.1玉米自交系及其野生种力基因中的插入缺失事件
2.3.2z2基因的单倍型多样性
2.3.3z2基因的核苷酸多态性和保守性
2.3.4中性进化检验
2.3.5系统发育和群体结构分析
2.4讨论
2.4.1z2基因在驯化中的选择效应
2.4.2z2基因的驯化史和群体结构
2.4.3z2基因的表达调控
2.5小结
第三章玉米低和单拷贝醇溶蛋白基因的DNA甲基化研究
3.1引言
3.2材料和方法
3.2.1实验材料
3.2.2实验方法
3.3结果与分析
3.3.1玉米δ-醇溶蛋白基因的DNA甲基化
3.3.2玉米γ-醇溶蛋白基因的DNA甲基化
3.3.3玉米β-醇溶蛋白基因的DNA甲基化
3.4讨论
3.5小结
第四章玉米Opaque2转录因子调控基因的全基因组分析
4.1前言
4.2材料与方法
4.2.1数据来源
4.2.2 O2转录因子结合基因的预测方法和流程
4.2.4 GO和KEGG分析
4.2.5组织表达分析
4.2.6转录因子分析及靶基因预测
4.2.7基因相互作用网络图的绘制
4.3结果与分析
4.3.1启动子中含特定模体序列基因的鉴定与分析
4.3.2启动子中含特定模体序列基因的GO分析
4.3.3利用ChIP-Seq对O2转录因子结合基因的鉴定
4.3.4O2结合基因的GO分析
4.3.5 O2结合基因的KEGG通路分析
4.3.6玉米野生型及其o2突变体中的差异表达基因
4.3.7 O2的调控基因
4.3.8差异基因的组织表达分析
4.3.9 O2调控网络构建
4.4讨论
4.4.1O2不同区域结合基因的功能分类
4.4.2 O2的调控基因及其调控效应
4.4.3o2突变后的胁迫响应
4.4.4玉米发育相关基因
4.5小结
第五章玉米野生型、opaque2突变体以及优质蛋白玉米的蛋白质组学分析
5.1引言
5.2材料与方法
5.2.1材料
5.2.2玉米贮藏蛋白和总蛋白的提取
5.2.3玉米总蛋白的酶解,除盐,质谱检测及差异表达蛋白的筛选
5.2.4 Western blot
5.3结果与分析
5.3.1玉米野生型及其o2突变体种子贮藏蛋白的积累及修饰
5.3.2玉米种子的蛋白质组学分析
5.3.3权重基因共表达网络分析
5.3.4转录组与蛋白组的联合分析
5.4讨论
5.4.1玉米种子贮藏蛋白的乙酰化和磷酸化修饰
5.4.2 O2的转录和转录后调控
5.5小结
第六章总结与展望
参考文献
附录