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3-甲基巴豆酰辅酶A羧化酶缺乏症的基因突变研究

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绪论

1 研究对象

1.1临床资料

1. 2主要仪器

1.3主要试剂

2 方法

2.1 MCCC1和MCCC2基因突变检测分析

2.2 基因新变异的证实

2.3 MCCD发生率统计

2.4 临床随访

2.5 基因型与临床生化表型关系分析

2.6 多种羧化酶缺乏症相关基因检测

3 结果

3.1 MCCC1和 MCCC2基因突变分析

3.2 基因新变异的证实

3.3 新生儿筛查MCCD发生率

3.4 临床治疗随访

3.5 基因突变与临床生化表型关系分析

3.6 多种羧化酶缺乏症相关基因检测结果

4 讨论

5 结论与创新点

5.1 结论

5.2 创新点

参考文献

致谢

附录I 综述: 3-甲基巴豆酰辅酶A羧化酶缺乏症的研究进展

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摘要

目的:对临床疑诊3-甲基巴豆酰辅酶A羧化酶缺乏症(3-Methylcrotonyl-coenzyme A carboxylase deficiency,MCCD)的患者进行MCCC1和MCCC2基因突变分析,从分子生物学水平证实临床诊断;了解中国人MCCC1和MCCC2基因突变谱,寻找热点突变;初步得出新生儿MCCD发生率;探讨基因突变与临床生化表型的关系以及血3-羟基异戊酰肉碱(C5-OH)筛查的阳性切割值。
  方法:2003年至2012年9月经新生儿筛查发现血C5-OH增高并接受随访的42例患儿纳入本研究。(1)采用常规PCR基因直接测序法对29例患儿及其父母进行MCCC1和MCCC2基因突变检测,以明确诊断;(2)对于基因新变异,通过50个正常对照相应位点测序、限制性内切酶酶切、逆转录PCR测序及不同物种氨基酸同源性分析等排除多态性,采用PolyPhen-2、SIFT、UniProt及PDB软件预测新变异对蛋白质结构和功能的影响;(3)初步统计新生儿MCCD发生率;(4)通过门诊或电话随访了解临床转归;(5)通过基因突变结果分组比较MCCD相关代谢指标,结合文献复习以探讨基因突变与临床生化表型的关系。
  结果:(1)29例(28个家系)基因分析发现16种基因突变,突变检出率为46.43%(26/56);其中4例诊断为母源性MCCD,4例良性MCCD,11例MCCD杂合子。16种突变中MCCC1突变13种,均为未报道的新变异,包括7种错义突变 c.764A>C/p.H255P、c.203C>T/p.A68V、211AG>CC/p.Q74P、c.964G>A/p.E322K、c.572T>C/p.L191P、c.295G>A/p.G99S和c.1331G>A/p.R444H,3种缺失突变c.1124delT、c.39_58del20和c.1518delG,1种插入突变c.ins1680A,2种框移突变c.639+2T>A和c.639+5G>T,其中c.ins1680A突变频率高达40.91%(9/22);MCCC2突变3种,包括1种新变异c.1406G>T/p.R469L,2种已报道的错义突变c.592C>T/p.Q198X和c.518C>T/p.S173L。(2)所有基因新变异均经过反向测序、父母基因测序、酶切分析或50个正常对照者基因测序得以证实,排除多态性可能;8种新错义变异位点氨基酸在不同物种中均具有高度或中度保守性,经软件预测可能影响蛋白结构和功能。(3)初步得出新生儿筛查MCCD发生率至少为1/98340。(4)42例随访至最大年龄8.8岁,所有患儿临床无症状,体格智能发育正常;母源性患儿生化代谢指标逐步下降或达正常,其他患儿血C5-OH仍多偏高。(5)携带基因突变的纯合子患儿筛查时血C5-OH浓度明显高于杂合子或未携带突变者。
  结论:(1)血MS/MS C5-OH增高、尿GC/MS3-MCG增高是诊断MCCD的主要指标;新生儿筛查发现C5-OH增高者需常规对其母亲筛查以诊断母源性MCCD。(2)临床高度疑似患儿应进行MCCD基因突变分析以明确诊断。(3)发现了中国MCCD基因14种致病性新突变,以MCCC1基因突变多见,c.ins1680A突变频率最高(40.91%)。(4)新生儿筛查MCCD发生率较低,可适当提高C5-OH筛查阳性切值至1umol/L以降低假阳性率。

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