阵列文库及阵列文库消减杂交用于肝癌相关基因筛选、表达和转录调控的初步研究

摘要

原发性肝癌的研究在中国基础和临床医学研究中占有重要的地位,肝癌相关基因的克隆、鉴定、表达检测和转录调控对于从基因水平认识肝细胞的生长、分化、再生和恶变的分子机理、阐明其信号转导过程和途径,不仅具有重要的研究意义,而且对于肝癌的早期基因诊断和治疗具有重大的临床应用价值和经济利用价值.该文建立了基于DNA阵列的阵列文库消减杂交技术(Arrayed Library Subtraction Hybridization,ALSH).以此技术结合基因芯片技术用于cDNA文库的大规模高效基因筛选,将之应用于肝脏cDNA文库的小规模的验证性研究得到了相当数量的已知基因、已知EST和一个新基因克隆;结合肝癌表达谱检测进行了肝癌相关基因的差异表达研究.阵列文库消减杂交结合体内染色质免疫沉淀可以进行全基因组尺度内的转录因子调控序列检测,我们进行了较小规模的验证确定了这一平台的有效性和实用性,进行了肝癌细胞丝裂霉素处理后核转录因子NFκB的表达和结合位点检测,获得NFκB在此状态下的结合位点序列克隆的阵列文库,得到一些新的受NFκB调控的下游基因的启动子结合序列.

目录

缩略词表

前言

第一部分阵列文库及阵列文库消减杂交用于肝癌相关基因筛选和差异表达的研究

材料与方法

结果

讨论

参考文献

第二部分阵列文库消减杂交结合染色质免疫沉淀方法用于基因转录调控的研究

材料与方法

结果

讨论

参考文献

小结

综述

附录

致谢