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球毛壳ND35菌株实时荧光定量PCR检测体系的建立及其在植物中的定殖检测

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摘要

球毛壳菌(Chaetomium globosum)ND35菌株是一株从健康毛白杨(Populus tomentosa)分离出的内生真菌。表现出对多种病原真菌的拮抗活性,其次生代谢物质对多种农作物有较好的促生作用,并且能增强其抗病性。为了解球毛壳ND35菌株在不同植物中的定殖情况,本文主要进行了球毛壳ND35菌株的实时荧光定量PCR检测技术条件的建立及和优化、运用实时荧光定量PCR技术检测不同植物不同组织中球毛壳ND35菌株的定殖情况、土壤中球毛壳ND35菌株生长繁殖情况的研究,取得了如下成果:
   1、利用已经获得的球毛壳ND35菌株特异片段设计了一对用于实时荧光定量PCR检测的引物,引物序列为ND35-1:GCTCGCAGCTCTGGTGCGGTG,ND35-2:GCCGATTGCCCATGTCCACCTC。以球毛壳ND35菌株基因组DNA为模板,以甘油醛-3-磷酸脱氢酶的基因为内参基因,利用此对引物对实时荧光定量PCR反应的最佳体系、反应程序及灵敏度检测等进行了初步探索,得到了较为理想的结果。
   2、利用优化的实时荧光定量PCR反应体系,对球毛壳ND35菌株在杨树、黄瓜、辣椒、烟草中的定殖情况进行了检测,结果表明,球毛壳ND35菌株在这几种植物的不同组织中均能定殖,但定殖情况在不同植物、不同组织中有较大差异,特别是一年生杨树不同组织在不同生长季节差别尤为显著,生长期越长的植物中定植情况差异越显著。
   3、利用实时荧光定量PCR反应体系,对球毛壳ND35菌株在土壤中的生长情况进行了检测,结果表明,利用建立的实时荧光定量PCR反应体系同样也可以检测球毛壳ND35菌株在土壤中的生长繁殖情况。

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