酶催化的一碳单元转移及相应酶抑制剂的量子化学研究和分子动力学模拟

摘要

酶催化的一碳单元转移反应是生命体内的重要过程.生命体内一碳单元(如甲基CH<,3>-,亚甲基CH<,2>=,甲酰基O=CH-,羟甲基HOCH<,2>-和脒基NH=C(NH<,2>)-等)的转移反应大多数是在叶酸辅酶的参与下进行的.四氢叶酸能够携带各种不同的一碳单元参与反应,其主要生理功能是接受各个不同氧化态的一碳单元,并把它们转移给适当的受体.一碳单元转移反应不仅与氨基酸的代谢密切相关,还涉及嘌呤和嘧啶的生物合成,是生命体内各种化合物甲基化的主要来源.探讨酶催化一碳单元转移反应的机理及其动力学行为,可以从电子水平上理解生命体内的化学反应过程,为生物制药和分子设计提供理论指导.

目录

文摘

英文文摘

原创性声明及关于学位论文使用授权的声明

前言

参考文献

第一章理论方法和研究现状

第一节研究方法简介

第二节酶催化的一碳单元转移反应的研究现状

参考文献

第二章5-氨基咪唑-4-甲酰胺核苷酸转甲酰基酶(AICAR Tfase)催化的一碳单元转移反应

第一节AICAR与叶酸辅酶模型化合物的一碳单元转移反应

第二节AICAR与叶酸辅酶分子的一碳单元转移反应

参考文献

第三章甘氨酰胺核苷酸转甲酰基酶催化的一碳单元转移反应

第一节无水分子参与的GAR Tfase催化的一碳单元转移：Mech.1

第二节水分子辅助的GAR Tfase催化的一碳单元转移：Mech.2

参考文献

第四章三种GAR Tfase抑制剂模型的量子化学研究

第一节无水参与时三种GAR Tfase抑制剂的作用机理

第二节无水参与时三种抑制剂反应活性的比较

第三节水分子的参与对抑制剂反应活性的影响

参考文献

第五章甘氨酰胺核苷酸转甲酰基酶(GAR Tfase)及其抑制剂的QM/MM计算

第一节协同反应机制下GAR Tfase的QM/MM计算

第二节GAR Tfase抑制剂协同机制的QM/MM计算

参考文献

攻读博士学位期间发表论文

致谢