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【6h】

大气压等离子体与细胞分子结构相互作用机理的反应分子动力学模拟

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摘要

1.1立题依据及研究意义

1.2大气压低温等离子体

1.2.1等离子体概述

1.2.2低温等离子体中的活性成分

1.3大气压低温等离子体在生物医学领域的应用

1.4大气压低温等离子体灭菌的微观机理

1.4.1生物学效应

1.4.2灭菌机理

1.4.3分子模拟方法在灭菌机理研究中的应用

1.5本课题的研究内容

第二章分子动力学模拟基本原理及仿真模型构建

2.1分子动力学模拟方法

2.2 ReaxFF力场

2.3系统模型构建

2.4本章小结

第三章活性氧与真菌细胞壁SCG分子不同结构相互作用的微观机理

3.1 SCG分子模型的构建

3.1.1模型介绍

3.1.2模拟参数

3.2活性氧对SCG分子不同结构的破坏路径

3.2.1 β-1,3-葡聚糖中单糖的破坏

3.2.2 β-1,3葡聚糖中糖苷键的破坏

3.2.3 β-1,6-葡聚糖中单糖的破坏

3.2.4 β-1,6-葡聚糖中糖苷键的破坏

3.3不同种类活性氧对SCG分子破坏的数据分析

3.3.1 ROS引发夺氢反应的分类统计

3.3.2 ROS破坏SCG化学键的分类统计

3.3.3 ROS破坏SCG单糖和糖苷键结构的分类统计

3.3.4 ROS破坏SCG主链和支链结构的分类统计

3.4本章小结

第四章不同浓度羟基自由基诱导破坏细菌菌膜PNAG分子的微观机理

4.1 PNAG分子模型的构建

4.1.1模型介绍

4.1.2模拟参数

4.2不同浓度羟基对PNAG分子破坏的微观路径及数据分析

4.2.1不同浓度OH破坏PNAG分子的基础破坏模式

4.2.2不同浓度OH破坏PNAG分子的阶梯反应路径

4.2.3不同浓度OH破坏PNAG分子的数据统计与分析

4.3不同浓度羟基与PNAG分子加成反应的微观路径及数据分析

4.4本章小结

5.1结论

5.2展望

参考文献

致谢

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