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缩略词表
摘要
1.1研究背景
1.1.1海洋生态环境
1.1.2海洋生态环境中的微生物
1.1.3细菌细胞壁中的肽聚糖
1.1.4海洋环境中的D型丙氨酸
1.1.5海洋环境中的二氨基庚二酸
1.2立题依据和研究内容
1.2.1立题依据
1.2.2研究内容
第二章深海细菌Pseudoalteromonas sp.CF6-2利用D-Ala代谢通路中关键酶的体外功能验证与表征
2.1引言
2.2材料和方法
2.2.1菌株与质粒
2.2.2主要试剂与试剂盒
2.2.3主要仪器与耗材
2.2.4培养基的配制
2.2.5菌株的培养与保藏
2.2.6酶的异源表达与纯化
2.2.7 D-Ala连接酶酶活测定及性质分析
2.2.8脱氢酶法测定Ala消旋酶D-Ala到L-Ala方向酶活
2.2.9氧化酶法测定Ala消旋酶L-Ala到D-Ala方向酶活
2.2.10 CD法测定Ala消旋酶双方向的酶活
2.2.11 D-Ala氨基转移酶1756的酶活测定
2.3结果
2.3.1 CF6-2以D-Ala为唯一氮源的生长情况
2.3.2 D-Ala连接酶0208、Ala消旋酶3059和D-Ala氨基转移酶1756的异源表达与分离纯化
2.3.3 D-Ala连接酶0208的酶活测定和性质分析
2.3.4 Ala消旋酶3059的酶活测定
2.3.5 D-Ala氨基转移酶1756的酶活测定
2.4讨论
第三章西太平洋水样中利用二氨基庚二酸细菌的多样性分析及菌株筛选
3.1引言
3.2材料和方法
3.2.1海水样品
3.2.2培养基
3.2.3主要试剂与试剂盒
3.2.4主要仪器与耗材
3.2.5菌株富集、多样性分析与筛选
3.3结果
3.3.1西太平洋水样中利用二氨基庚二酸菌株的富集与多样性分析
3.3.2西太平洋水样中利用二氨基庚二酸菌株的分离和种属鉴定
3.4讨论
第四章西太平洋细菌利用二氨基庚二酸的代谢通路研究
4.1引言
4.2材料和方法
4.2.1菌株与质粒
4.2.2培养基
4.2.3主要试剂与试剂盒
4.2.4主要仪器与耗材
4.2.5基因组测序与分析
4.3结果
4.3.1 Microbacterium sp.A32-1利用DAP能力验证、基因组测序和代谢通路分析
4.3.2 Thalassospira sp.B30-1利用DAP能力验证、基因组测序和代谢通路分析
4.4讨论
全文总结与展望
参考文献
致谢