苏禄海和菲律宾海深海沉积物中古菌群落多样性研究

摘要

为研究苏禄海深海沉积物中古菌群落的多样性，应用16S dDNA技术对环境样品进行基因文库的构建和分析，构建了6个基因文库，获得543个克隆，分属于137个OTUs。基于16S rDNA序列的同源性比较，绘制系统进化树，进行统计学分析，表明苏禄海深海沉积物中古菌序列为泉古菌和广古菌，其中50％以上的序列归属于Miscellaneous Crenarchaeotic Group(MCG)， 30％的序列来自于Marine Benthic Group D(MBG-D)、South African Gold Mine EuryarchaeoticCroup(SAGMBG)和Marine Benthic Group B(MBG-B)种属。研究表明苏禄海沉积物中有丰富多样的古菌群落，在不足5m的沉积物中垂直分布着11种古菌类群。
　　 为研究菲律宾海深海沉积物中的古菌群落垂直分布特征，选取沉积物环境样品，应用16S rDNA技术对环境样品进行基因文库的构建和分析，构建了8个基因文库，获得711个克隆，分属于102个OTUs。结合系统进化树分析，研究表明该沉积物样品古菌多样性较高，有11个种属，都归属于泉古菌和广古菌，在数量上泉古菌多于广古菌，在种类上泉古菌却少于广古菌。古菌群落特征显著，呈明显垂直分布。发现部分甲烷厌氧氧化古菌(ANME-1)以及一些和甲烷厌氧氧化活动密切相关的古菌Rice cluster GPI和甲烷八叠球菌。
　　 对热带西太平洋地区苏禄海和菲律宾海深海沉积物中的古菌群落结构进行比较分析，发现热带西太平洋深海沉积物中古菌多样性较高，共获得16种古菌类群，分属于泉古菌和广古菌。两个沉积物区的古菌在群落组成及其数量多寡上存在着显著的差异，综合同源序列分析与环境因子分析，表明该沉积物区古菌群落垂直分布特征与沉积物的环境因素关系密切。

目录

1 引言

2 材料和方法

3 实验结果

4 讨论

5 结论

致谢

参考文献

作者简介

论文说明:插图和附表清单、缩略语表

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