应用分子生物学技术解析不同处理状况下土壤微生物群落结构的变化

摘要

本文应用分子生物学技术解析不同处理状况下土壤微生物群落结构的变化进行了研究。文章采用组合微生物分子生态学方法(PCR-DGGE，ERIC-PCR)与培养分离技术，评价了不同稀释梯度，不同培养天数，不同培养基对土壤系列稀释富集培养后微生物组成的影响以及系列稀释富集培养的重复性。PCR-DGGE及ERIC-PCR指纹图谱表明，CMC96孔板富集的微生物组成跟LB96孔板富集的明显不同，在CMC96孔板中富集培养2天、4天以及8天，其菌群结构也不一样，而且随稀释梯度的变化，富集的微生物组成也在发生变化，在低稀释度下，同一稀释度内重复的相似性高，在高稀释度下，其相似性差。纯菌分离结果表明，采用传统的分离培养方法，从土壤中只获得了19种ARDRA类型，而在几个最高稀释度悬液的富集培养物中，就获得了34种ARDRA类型。测序结果表明，大部分分离物属于Proteobacteria(83.3％)，剩下的Actinobacteria占14.0％，Bacteroidetes占2.0％，未鉴定的(Unclassified)占0.7％。以上结果说明，组合系列稀释富集培养与微生物分子生态学监测方法，能检测和分离到更多的土壤微生物种类，为更好开发利用丰富的土壤微生物资源提供了方法上的摸索和支持。

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文摘

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前言

文献综述 第一章土壤微生物分子生态学及其研究方法进展

文献综述 第二章土壤DNA提取及纯化方法研究进展

实验部分 第三章土壤微生物分子生态学研究中总DNA的提取

实验部分 第四章应用PCR-RFLP及PCR-TGGE技术监测农田土壤微生物短期动态变化

实验部分 第五章两种外源微生物制剂加入后土壤中微生物群落结构及纤维素水解活性动态变化的研究

实验部分 第六章秸秆还田后土壤微生物群落结构变化的初步研究

实验部分 第七章土壤系列稀释富集培养后微生物组成变化的分析

全文总结

参考文献

附录

致谢

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