水稻部分骨干亲本的指纹图谱构建和遗传多样性分析

摘要

水稻(Oryza sativa L)是我国乃至世界的主要粮食作物，是世界近一半人口的主要热量来源。这些年来我国在品种选育方面取得了喜人成果，为了提高育种家的积极性，保证育种成果的合法推广，构建水稻品种的指纹图谱，研究其遗传多样性对今后品种保护和水稻研究工作至关重要。本研究利用56对微卫星标记对60份水稻主要亲本材料进行了DNA指纹图谱构建和遗传多样性分析研究，主要结果如下:
　　1.从72对SSR引物中筛选出56对稳定性好、杂带少、多态性丰富并且在水稻12条染色体上分布均匀的SSR引物为核心引物进行研究分析。56对SSR引物在60份水稻材料中一共扩增出217个多态性片段，每个SSR位点可检测出2-9个等位基因不等，平均每对引物可检测出3.88个等位基因。56对引物的平均多态性频率为0.49，平均多态信息含量为0.48，平均基因多样性为0.52，平均有效等位基因数为2.22。在一定程度上反映了试验微卫星标记多态性比较丰富，对这60份亲本材料的区分能力较强，但试验材料的异质程度不高，遗传多样性不够丰富。
　　2.利用筛选出的56对SSR引物，构建了60份水稻亲本材料的DNA身份证，即指纹图谱，并利用此图谱对杂交组合广占63-4S/9311、培矮64S/9311和C815S/蜀恢527的杂交种进行了纯度鉴定，利用SSR分子标记得到的纯度与田间鉴定的纯度结果基本一致。利用DNA指纹图谱进行种子纯度鉴定具有一定的代表性和可信度，也是解决今后杂交水稻纯度鉴定的有效途径。
　　3.对本试验的60份亲本材料进行SSR聚类分析，60份亲本材料的遗传相似系数范围为0.56-0.98，以遗传相似系数为0.56处为阈值，可将籼稻和粳稻分开为两个群，说明彼此亲缘关系相对较远。以遗传相似系数为0.73为阈值，可将籼稻群分为3个亚群，两系不育系主要划归入第1、2亚群，三系不育系主要划归入第2亚群，恢复系主要划归入第3亚群。以上基于分子标记的遗传分析有效地鉴定了各材料间的亲缘关系，对今后的水稻育种工作上具有一定科学意义。

目录

声明

摘要

缩略词表

1 前言

1．1 水稻概述

1．1．1 水稻的分类

1．1．2 杂交水稻的研究进展

1．2 水稻指纹图谱的研究进展

1．3 应用分子标记构建DNA指纹图谱的研究进展

1．3．1 形态标记

1．3．2 细胞学标记

1．3．3 生化标记

1．3．4 分子标记

1．4 水稻指纹图谱构建的目的

2 材料与方法

2．1 实验材料

2．2 田间试验设计和农艺性状考察

2．3 不育系育性统计及不育类型鉴定

2．4 水稻DNA提取和SSR标记的选择

2．5 PCR扩增及产物检测

2．5．1 PCR扩增

2．5．2 聚丙烯酰胺凝胶电泳

2．6 种子纯度鉴定

2．7 指纹图谱构建及数据分析

3 结果与分析

3．1 指纹图谱构建

3．2 多态性分析

3．3 杂交种纯度鉴定

3．4 不育系花粉不育类型结果

3．5 亲本资源的SSR遗传多样性分析

3．5．1 恢复系农艺性状统计分析

3．5．2 亲本资源的SSR遗传多样性分析

3．5．3 供试水稻亲本材料的遗传多样性分析

4 讨论

参考文献

附录

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