声明
摘要
文中关键缩略词中英文对照表
第一章文献综述
1．罗非鱼产业发展概况
2．无乳链球菌病的症状、致病机理及防治措施
2．1致病症状
2．2致病机理及途径
2．3防治措施
3．选择育种
4．鱼类抗病性状相关组学研究进展
4．1鱼类抗病选育转录组学研究进展
4．2鱼类抗病选育蛋白质组学研究进展
5．罗非鱼免疫相关基因研究进展
6．本论文研究的目的和意义
第二章吉富罗非鱼家系的构建及抗病性能评估
1．引言
2．材料与方法
2．1实验材料来源
2．2家系构建
2．4无乳链球菌(HN016菌株)半数致死浓度的测定
2．5家系鱼人工腹腔注射感染无乳链球菌
2．6免疫相关酶活力的测定
2．7统计分析
3．结果
3．1家系构建结果
3．2无乳链球菌HN016菌株感染吉富罗非鱼半数致死浓度
3．3吉富罗非鱼感染无乳链球菌后的症状
3．4不同家系出现发病症状时间分析
3．5不同家系感染无乳链球菌HN016菌株结果
3．6高抗病和易感病家系感染无乳链球菌后肝脏免疫相关酶活性表达差异
4．讨论
5．小结
第三章吉富罗非鱼不同抗性家系感染无乳链球菌后脾脏转录组差左异分析
1．引言
2．材料与方法
2．1实验动物
2．2 HN016菌株的复壮与培养
2．3 HN016菌株感染实验及样品收集
2．4 RNA提取、文库构建和测序
2．5测序数据从头组装
2．6基因注释
2．7差异表达基因的鉴定
2．8基于qPCR的实验验证
3．结果
3．1吉富罗非鱼脾脏组织表达短序序列分析
3．2吉富罗非鱼脾脏组织转录组测序的组装
3．3基因识别与注释
3．4差异表达基因的鉴定与分析
3．5基因的富集与通路分析
3．6 RNA-seq结果的qPCR验证
4．讨论
4．1免疫成分
4．2病原体识别
4．3氧化应激／凋亡
5．小结
第四章吉富罗非鱼不同抗病性家系脾脏蛋白质组差异分析
1．引言
2．实验材料与方法
2．1实验样品来源
2．2脾脏组织蛋白质的提取及iTRAQ操作流程
3．实验结果与分析
3．1吉富罗非鱼脾脏蛋白质提取结果
3．2二维液相色谱分离
3．3蛋白质鉴定结果
3．4差异表达蛋白质(DEPs)的筛选
3．5差异蛋白质分析
3．6易感病家系和高抗病家系DEPs分析(组间分析)
3．7蛋白质组和转录组联合分析
4．讨论
4．1抗氧化应激
4．2细胞骨架
4．3翻译修饰和能量代谢
4．4免疫反应
5．小结
第五章吉富罗非鱼抗病候选基因Cathepsin B基因的克隆及免疫应答分析
1．引言
2．材料与方法
2．1实验样品采集
2．2 RNA提取和反转录
2．3 CTSB基因序列全长扩增
2．4序列的拼接
2．5序列生物信息学分析
2．7实时荧光定量PCR
3．结果与分析
3．2吉富罗非鱼CTSB基因二级结构预测分析
3．3吉富罗非鱼CTSB基因三级结构预测分析
3．4吉富罗非鱼CTSB基因系统发育分析
3．5吉富罗非鱼CTSB基因表达规律
4．讨论
5．小结
第六章吉富罗非鱼抗病候选基因Galectin-3基因的克隆及免疫应答分析
1．引言
2．1实验材料
2．2 RNA的提取及反转录
2．3 galectin-3基因序列全长扩增
2．4序列拼接和
2．5序列生物信息学分析
2．6 galectin-3基因系统进化分析
3．1吉富罗非鱼galectin-3基因的序列特征分析
3．2 galectin-3基因的系统进化分析
3．3无乳链球菌感染吉富罗非鱼后galectin-3基因的免疫应答分析
3．4嗜水气单胞菌感染吉富罗非鱼后galectin-3基因的免疫应答分析
4．讨论
5．小结
结论
创新点
下一步工作计划
参考文献
附录
攻读博士学位期间本人主持的项目
攻读博士学位期间获得的科技成果
攻读博士学位期间完成的研究论文
致谢
