桦木科叶绿体基因组的系统发育分析

目录

声明

第一章 前言

1.1 系统发育

1.1.1 系统发育学的发展

1.1.2 系统发育树及其构建

1.1.3 分化时间的估算

1.2 叶绿体基因组

1.2.1 叶绿体基因组概述

1.2.2 叶绿体基因组在系统发育中的应用

1.3 桦木科

1.3.1 桦木科简介

1.3.2 桦木科系统发育研究进展

1.4 研究目的

第二章 材料与方法

2.1 物种选择与序列获取

2.2 叶绿体基因组的组装与注释

2.3 桦木科叶绿体基因组的比较基因组学分析

2.4 叶绿体基因组及ITS序列的多序列比对

2.5 系统发育分析

2.6 分化时间估算

第三章 结果分析

3.1 桦木科叶绿体基因组的组装与注释

3.2 桦木科叶绿体基因组的比较基因组学分析

3.2.1 桦木科叶绿体基因组的结构差异分析

3.2.2 桦木科叶绿体基因组的序列变异性分析

3.2.3 桦木科叶绿体基因组蛋白质编码基因的变异性分析

3.3 桦木科及外类群的叶绿体基因组序列和ITS序列比对

3.4 系统发育分析

3.5 桦木科分化时间估算

第四章 讨 论

4.1 桦木科24个叶绿体基因组的比较基因组学分析

4.2 桦木科系统发育分析

4.2.1 桦木科系统发育关系的重建

4.2.2 桦木科物种分化时间的估算

4.3 总结与展望

参考文献

附表

在学期间的研究成果

致谢