声明
1 文献综述
1.1甘蔗基础生物学研究进展
1.2 植物着丝粒研究现状
1.3 植物着丝粒的研究方法
1.4 立题依据和研究意义
1.5 主要研究内容与技术路线
2 材料与方法
2.1 实验材料
2.2 实验方法
2.3 实验数据与分析
3 结果与分析
3.1 Molokai6081和LA Purple CenH3免疫荧光实验
3.2 Molokai6081和LA Purple功能着丝粒DNA序列的获得
3.3 Molokai6081和LA Purple测序结果统计
3.4 Molokai6081和LA Purple基因组重复序列的聚类分析和组成分析
3.5 Molokai6081和LA Purple候选着丝粒序列的挖掘与丰度分析
3.6 Molokai6081和LA Purple着丝粒特异重复序列的细胞学验证
3.7 Molokai6081和LA Purple着丝粒DNA序列的组成与结构
3.8 三个甘蔗种着丝粒DNA序列及物种演化分析
3.9 三个甘蔗种基因组着丝粒区域的定位
3.10 三个甘蔗种着丝粒区域的反转录转座子插入基因组时间分析
3.11 三个甘蔗种基因组着丝粒区域的基因表达谱分析
4 讨论与展望
4.1 讨论
4.2 展望
参考文献
附录A ChIP高通量测序文库质量检测
附录B Molokai6081着丝粒序列引物信息
附录C LA purple着丝粒序列引物信息
附录D AP85-441着丝粒活跃基因表达量
附录E Molokai6081着丝粒活跃基因表达量
附录F LA purple着丝粒活跃基因表达量
附录G AP85-441着丝粒活跃基因GO富集分析
附录H AP85-441着丝粒活跃基因KEGG通路分析
附录I AP85-441着丝粒位置示意图
附录J Molokai6081着丝粒位置示意图
附录K LA purple着丝粒位置示意图
攻读硕士学位期间研究成果
致谢