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A Learning-Based Formulation of Parametric Curve Fitting for Bioimage Analysis

机译:基于学习的BioImage分析参数曲线配方

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摘要

Parametric curve models are convenient to describe and quantitatively characterize the contour of objects in bioimages. Unfortunately, designing algorithms to fit smoothly such models onto image data classically requires significant domain expertise. Here, we propose a convolutional neural network-based approach to predict a continuous parametric representation of the outline of biological objects. We successfully apply our method on the Kaggle 2018 Data Science Bowl dataset composed of a varied collection of images of cell nuclei. This work is a first step towards user-friendly bioimage analysis tools that extract continuously-defined representations of objects.
机译:参数曲线模型可以方便地描述和定量表征生物图像中对象的轮廓。 不幸的是,设计算法以平滑地将这些模型平稳地拟合到图像数据上,经典需要重大域专业知识。 这里,我们提出了一种基于卷积神经网络的方法来预测生物物体轮廓的连续参数表示。 我们成功地在Kaggle 2018数据科学碗数据集上应用了由细胞核的各种图像集合组成的。 这项工作是迈向用户友好的生物贴图分析工具的第一步,可以提取对象的不断定义的表示。

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