メタバーコーディングと定量PCRから得た水生昆虫環境DNA量と水生昆虫現存量の関係

摘要

河川水から抽出したDNA(環境DNA)をテンプレートとして無脊椎動物のcytochrome oxidase subunit 1領域の濃度を定量PCRにより定量した.さらに同ーの遺伝子領域をメタパーコーディング解析し，得られた全塩基配列数のうち水生昆虫6目（カゲロウ，カヮゲラ，トビケラ，ハエ，トンボ，コゥチュウ）に属する塩基配列の相対存在比を，定量DNA濃度と掛け合わせ，水生昆虫由来の環境DNA濃度（copies/L)を求めた.捕獲調査により得られた水生昆虫の現存量と相関分析した結果，水生昆虫由来の環境DNA定量値は全採集個体数密度（相関係数0.74，p<0.01),カゲロウ目，カヮゲラ目，ハエ目の個体数密度と正の相関を示した.これらの分類群については回帰式を推定することができ，本手法が環境DNAを用いた水生昆虫量の定量に有効である可能性を示した.