驴血液白细胞转录组的重头组装与驴和马之间表型相关基因的比较分析

摘要

在农业机械化之前,农民饲养驴主要为役用和驮运.随着驴的役用驮运价值的下降,当代的中国农民饲养驴的目的转变为取肉、取奶和取皮.为了维持中国养驴业的规模,遗传育种工作者应该更关注人们对驴的这些新需求所关联的基因型.通过德州驴血液白细胞转录组的深度测序,检测到264,714条独特的驴基因片段,并预测了38,949条蛋白片段.通过序列比对,对这些驴的基因片段和蛋白片段进行了注释.并将驴的蛋白序列与哺乳动物表型数据库进行关联.因为耳朵的大小是驴和马之间的显著的形体差异之一,根据驴的转录组数据和哺乳动物表型数据,预测出可能决定驴耳朵性状的基因,包括HIC1、PRKRA和KMT2A.因为驴的基因组尚未完全公布,所得的转录组数据,有助于人们对驴基因型和表型进行初步的关联分析.