家蚕腺苷三磷酸结合盒转运子B亚族基因Abcb6的克隆、组织表达和序列分析

摘要

腺苷三磷酸结合盒转运子B亚族成员ABCB6（ATP-binding cassette transporter isoform B6,ABCB6)是一个非常重要的半分子转运子,在哺乳动物中主要参与细胞内卟啉类化合物的转运和铁离子平衡的调节。利用人的ABCB6基因编码氨基酸序列在家蚕EST数据库中进行tblastn检索,把检索到的EST 序列进行电子延伸和克隆重叠群拼接,根据拼接结果设计引物进行RT-PCR 扩增、克隆测序验证。通过反转录聚合酶链式反应(RT-PCR)成功克隆了家蚕Abcb亚族基因第1个成员BmAbcb6的完整开放阅读框。生物信息学方法分析发现,BmAbcb6 有16个外显子和15个内含子,编码850个氨基酸残基,分子质量为96.35 kD,等电点8.23;BmAbcb6含有一个核苷酸结合结合结构域和10个α螺旋构成的跨膜结构域,是家蚕Abcb 亚族成员。半定量RT-PCR方法分析BmAbcb6在家蚕5 龄第3 天幼虫不同组织中均有表达,其中以精巢中的表达量相对最高。研究结果为进一步研究该基因的功能奠定了基础。