梅花鹿生长激素受体(GHR)基因完整编码区序列生物信息学分析

摘要

从GenBank中下载梅花鹿、山羊、牛、猪、北极狐、大熊猫、人、猕猴、小鼠、大鼠、鸡、家鹅、绿头野鸭及金鱼的GHR基因完整编码区(CDS)及氨基酸序列,对梅花鹿与其他13个物种GHR基因的CDS及氨基酸序列进行相似性分析,进一步基于氨基酸序列构建系统进化树,利用BioEdit 7.0与相关在线软件对梅花鹿GHR基因的碱基组成及其编码蛋白的理化性质和结构特征进行生物信息学预测分析.结果表明:梅花鹿与山羊、牛的GHR基因氨基酸序列相似性较高,亲缘关系最近;梅花鹿GHR基因CDS长度为1905bp,编码634个氨基酸,碱基A+T含量高于G+C;其编码的蛋白是一种分子质量为70.9278ku,等电点为4.56的疏水性不稳定酸性蛋白;该蛋白含有1个信号肽,属一种分泌型蛋白;存在1个强跨膜区、36个广泛磷酸化位点,二级结构元件以无规则卷曲为主.