棉花黄萎病菌群体基因组学分析

摘要

本研究利用新一代高通量测序技术对高毒力菌株VDG1和低毒力菌株VDG2进行全基因组测序，组装结果显示两株菌基因组大小分别为32.61Mb和34.19Mb.同时，对78株不同毒力多菌株的重测序结果分别以VDG1和VDG2作为参照基因组序列进行分析。基于SNP构建的种群系统发生树显示重测序的78株病原菌分为进化上关系不同的两组，一组基因型接近VDG1，包含61株病原菌；另外17株菌则与VDG2菌株呈现进化上关系较近，统计分析显示两组菌致病指数组间分布差异显著，而且低毒力菌群在我国的分布呈现出地域。且经进一步研究，毒力较强的落叶型菌株在种群分布中占有有事。