链孢囊菌SC119的全基因组测序及分析

摘要

链孢囊菌以其孢囊结构区别于其它放线菌,该类菌产生许多生物活性物质,如具有抗真菌活性的sinefungin和ECE抑制剂。前人发现链孢囊菌SC119含有一个小的质粒,对其进行了全基因组序列测定,结果显示SC119染色体为环型,GC含量为70.6％,全长10,745,310bp,除染色体外,SC119还有三个自主复制的环型质粒,分别是6824 bp的pSC1、92,244 bp的pSC2和407,771bp的pSC3。全基因组预测编码9704个基因，其中6122个推测具有特定的功能，3582个为假设性蛋白质。基因组含有80个RNA基因，包括62个tRNA基因和18个rRNA基因。基因组有25个预测的次级代谢产物基因簇。