藏药藏锦鸡儿4种基原植物的DNA条形码鉴别

摘要

目的：利用ITS2、tmH-psbA和rbcL条形码序列,对藏药藏锦鸡儿的4种基原植物进行鉴别. 方法：以藏药藏锦鸡儿的4种基原植物[锦鸡儿Caragana sinica(Buchoz)Rehd、鬼箭锦鸡儿Caraganajubata(Pall.)Poir、二色锦鸡儿Caragana bicolor Kom和川西锦鸡儿Caragana erinacea Kom]的17份样品为研究对象,采用试剂盒法提取基因组DNA,利用通用引物,扩增ITS2、trnH-psbA和rbcL序列,并对PCR产物进行双向测序.所得序列经CodonCode AlignerV6.0.2拼接后,采MEGA5.0软件进行序列比对,计算碱基组成和变异.利用TaxonGap2.4.1软件,分析3种DNA条形码序列在藏锦鸡儿4种基原植物中的种内与种间变异. 结果：经过拼接校对后,藏锦鸡儿4种基原植物的ITS2序列长度为221～228bp,trnH-psbA序列长度为389～416bp,rbc L序列长度为533bp.其中,rbcL序列的保守性最强,ITS2序列变异位点的转换/颠换比值最高.3种条形码中的任意一种单独使用时,均不能同时鉴别4种基原植物,但可以成功鉴别鬼箭锦鸡儿和川西锦鸡儿.trnH-psbA序列可以鉴别鬼箭锦鸡儿和锦鸡儿. 结论：ITS2、trnH-psbA、rbcL序列能够用于藏药藏锦鸡儿基原植物的鉴别.