鸭源鸡杆菌外膜蛋白A基因克隆及结构与功能分析

摘要

为筛选潜在的保护性抗原基因研制鸭源鸡杆菌(Gallibacteriumanatis,G.anatis)基因工程疫苗,参考GenBank中G.anatis UMN179的外膜蛋白A(Outer membrane protein A,OmpA)基因序列设计一对引物,对鸭源鸡杆菌PDS-RZ-1-SLG株的ompA基因进行克隆,并应用相关软件和程序对其核苷酸及氨基酸序列进行生物信息学分析.结果显示om2pA基因大小为1083bp,编码361个氨基酸;与鸭源鸡杆菌UMN179、F149及12656/12的OmpA氨基酸相似性分别为93.2％,95.2％,92.7％;OmpA分子质量为38.4kDa,等电点为6.77,是能够稳定存在的蛋白,N端有一个疏水性的α螺旋信号肽,C端有一个疏水性的β折叠区域,并且在外膜表面存在两个保守性的B细胞线性表位.本研究首次成功克隆了鸭源鸡杆菌PDS-RZ-1-SLG株的ompA基因,并对其结构与功能进行初步分析和预测,为进一步研究其生物学功能及其应用奠定基础.