华东地区H5亚型禽流感病毒分子流行病学调查

摘要

1996年从广东地区发病鹅群中首次分离到以A/Goose/Guangdong/1/96(GD/96)株为代表的H5N1高致病性禽流感病毒(Highly Pathogenic Avian Influenza Virus,HPAIV).此后,GD/96-like病毒在我国传播开来,蔓延到亚洲,继而传到欧洲、北美的多个国家和地区,给养禽业造成了巨大的经济损失,对公共卫生安全构成了严重的威胁.根据最新WHO对2003-2017年期间的H5N1感染人类案例统计结果显示,现已有858例感染,死亡453例,死亡率达到了52.8％.根据最近几年的文章报道新出现了多种能感染人的亚型,例如H7N9(2013年)、H10N8(2013年)、H5N6(2013年).另外H6N1、H7N2、H7N3、H7N7、H9N2和H10N7也有发生人感染的案例.因此对禽流感病毒的持续的流行病学调研具有重大的经济学和公共卫生学意义.自2016年1月至今，在华东地区(江苏、浙江、江西、安徽、山东等地)的活禽市场采集泄殖腔、口咽试子共1189份。先通过荧光定量PCR检测流感阳性样品，然后将阳性样品通过尿囊腔接种SPF鸡胚分离病毒，血凝及血凝抑制试验初步鉴定病毒的HA亚型。根据文献报道的引物，利用RT-PCR方法扩增病毒的全基因片段，应用DNAStar和MEGA7等软件进行测定序列的拼接、比对，并对病毒的全基因组进行遗传进化分析。