广东新型鸭呼肠孤病毒σB蛋白基因克隆及序列分析

摘要

为研究广东新型呼肠孤病毒(NDRV)的基因变异及遗传演化情况,本试验从广东不同鸭场病死鸭肝脏、脾脏等组织脏器中分离到8株流行毒株,用RT-PCR方法进行σB蛋白基因扩增、克隆与序列分析,并与其他毒株σB蛋白的氨基酸特性、蛋白抗原和蛋白基因系统进化进行比对分析.结果表明,广东省鸭群中感染的NDRV与国内其他地区报道的DRV核苷酸序列相似性很高,达96.6％～99.5％,而与禽呼肠孤病毒(ARV)和番鸭呼肠孤病毒(MDRV)的相似性则较低,分别为64.6％～66.5％和66.2％～67.1％;8株NDRV之间的核苷酸序列相似性高达97.7％～99.7％.与其他毒株比较结果显示,本试验分离的NDRV毒株磷酸化位点均比参考毒株ARV和MDRV少,且大多数区域的抗原指数都较高,抗原性与MDRV较为接近,遗传进化分析结果表明,NDRV和国内其他NDRV处于独立的进化分支,ARV和MDRV则处于不同分支.结果表明,广东省流行的NDRV毒株σB蛋白基因序列高度保守,且广东地区分离的NDRV与国内其他地区分离的NDRV没有明显的地域差异.