12株新城疫病毒的F基因和HN基因序列分析

摘要

本试验从广东部分地区疑似患新城疫家禽病料分离鉴定获得的12株NDV,采用RT-PCR方法对12株NDV的F基因和HN基因扩增,扩增产物经克隆并测序后与GenBank数据库中的参考毒株作遗传进化和同源性分析.F基因遗传进化分析结果显示,12株分离株中有9株属于基因Ⅶ型,2株属于基因Ⅸ型和1株属于基因Ⅵ型.F基因和HN基因同源性分析结果显示,12株毒株与参考毒株间的相似性存在较大的差异,并与目前疫苗株LaSota、B1、Mukteswar和Clone30的相似性在80.9％～91.9％之间;12株毒株间相似性的差异较大,9株基因Ⅶ型的毒株中的5株鹅源毒株和1株鸭源毒株之间的相似性高于97％,但与其他3株Ⅶ型病毒之间的相似性仅在83.4％～87.8％之间.另外,12株分离株与NDV强毒株的氨基酸特征相符,有10株分离株的HN基因第514氨基酸残基出现Ⅰ→Ⅴ的变异,有9株分离株的F基因和HN基因的中和抗原位点出现变异.由此推测,当前广东地区大部分的分离株与传统疫苗株之间存在抗原性差异,本试验数据为今后的NDV诊断与免疫防控研究提供更多详细的参考资料.