气味结合蛋白与(反)-β-法尼烯及其结构类似物的结合模式研究

摘要

(反)-β-法尼烯(EBF)作为昆虫的报警信息素,对驱避蚜虫具有良好的生物活性.负责调控EBF的昆虫气味结合蛋白OBP7,能够识别气味小分子并携带它们穿过亲水性的淋巴液到达嗅觉受体上,从而发挥生物功能.本文通过计算化学中分子对接和分子动力学的方法,研究了EBF分子及与其结构相似的6种植物挥发物与OBP7的结合模式,同时验证了蛋白在动力学模拟过程中的稳定性.对接结果发现:化合物分子与蛋白的相互作用主要以疏水作用为主,更为重要的是,EBF中的末端双键与Tyr49有π-π相互作用,当被苯环替代后的活性也与之相近,长链中C的个数越多对活性越有利,现以8个C为宜.本研究为基于昆虫OBP7晶体结构的新型EBF类似物的生物合理设计提供理论指导.