小菊锌指蛋白基因cDNA全长克隆及结构分析

摘要

目前植物耐盐碱研究一直是人们研究的热点,然而关于菊花耐盐碱相关研究报道较少。本文从大量菊花资源中筛选出抗盐碱品系小菊‘阳光’,并利用RT-PCR方法,从150mM碳酸钠处理的小菊‘阳光’叶片中分离得到一个锌指蛋白cDNA全长克隆。测序分析其全长794bp。编码区编码169个氨基酸。数据库比对发现其含有AN1型锌指结构,序列模式为C-X2-C-X(9-12)-C-X(1-2)-C-X4-C-X2-H-X5-H-X-C,由Cys110-Cys113-Cys131-His134以及Cys124-Cys126-Cys142-His140分别围绕锌离子与其它氨基酸共同组成两个锌指四面体结构,命名为DMSTZF(Dendranthema morifolium stress-tolerance zincfinger)。同源性比较发现,其与水稻逆境反应蛋白OSISAP1具有54％的同源性,锌指保守区结构完全相同,并与其它植物的逆境相关锌指蛋白存在较高同源性。在锌指结构域的5'端还存在3个与DNA特异性结合的富G的GNCGTG和GTGGNG启动子序列,与植物耐盐性密切相关。