肺癌早期诊断的DNA甲基化分子标志物的筛选和临床应用研究

摘要

目的：筛选并建立一组可能会作为非小细胞肺癌(NSCLC)早期诊断的甲基化标志物，运用多重甲基化特异性聚合酶式链反应技术检测肺癌患者的组织DNA的甲基化水平，验证其用于肺癌早期诊断的敏感性和特异性，以用于肺癌的早期诊断。方法：基于前期在肺癌甲基化分子标志物筛选方面的成果，结合合作单位在鼻咽癌项目研究的基础，初步组成两套多重甲基化特异性PCR检测体系，并用于肺癌细胞系和肺癌组织的检测，初步验证该方法用于肺癌检测的可行性。淘汰敏感性和特异性较低的甲基化标志物，筛选出敏感性和特异性较高的标志物，优化组成DLEC1,PITX2,TBXS,CALCA,RASSFIA,HOXA9六个标志物的MMSP检测体系，检测天津医科大学总医院肺外科住院并行手术治疗的40例肺癌患者的肺癌标本和相应的正常肺组织，以及5例手术切除的非肿瘤患者的正常肺组织作为对照，分别计算各个检测甲基化标志物的阳性率，并分析6个甲基化标志物联合检测肺癌的敏感性和特异性。结果:MMSP检测体系1包括CDH13,TSLC1,APC,RASSFIA和MGMT这5个基因；MMSP检测体系2包括RARβ、Ecadherin,ASC,TSLC1和RASSFIA这五个基因；通过摸索和条件优化以DLEC1,P工TX2,TBXS,CALCA,RASSFIA和HOXA9六个甲基化标志物组成的MMSP检测体系3可以用于肺癌组织的检测，检测了40对肺癌和配对正常肺组织以及5例非肿瘤患者的肺组织;DLEC1,PITX2,TBXS,CALCA,RASSFIA和HOXA9这六个甲基化标志物甲基化的阳性率与患者性别、年龄，是否吸烟，肿瘤类型、是否接受新辅助治疗及肿瘤分期无明显关系.结论:本研究证明了多重甲基化特异性PCR检测技术可用于肺癌早期诊断;成功筛选鉴定出DLEC1,PITX2,TBXS,CALCA,RASSFIA,HOXA9六个标志物，联合预测非小细胞肺癌的灵敏性达90，特异性达91.1%;联合分析Affymetrix基因芯片数据和Illumina甲基化芯片数据，筛选出1382个甲基化标志物，是否可以应用于肺癌早期诊断，需要进一步验证。