双河洞放线菌多样性和抗菌活性的初步研究——以阴河洞和杉林洞为例

摘要

目的:初步探究双河洞系统中阴河洞和杉林洞两个支洞的放线菌多样性,并对分离菌株的抗菌活性进行筛选.方法:以纯培养方法获得放线菌,以16S rRNA基因序列比对,分析菌株类别,获得的菌株进行液体发酵,纸片琼脂扩散法测定其发酵产物对真菌和细菌的抗菌活性,同时用PCR 技术进行NRPS、PKSⅠ和PKSⅡ抗生素生物合成基因的探测.结果:从两个支洞样品中分离到的放线菌分布于7个科10个属,两个洞共66 株放线菌中有32株的发酵产物在至少一个抗菌活性筛选中显示阳性,总阳性率为48.5％.抗生素生物合成基因的初步探测结果显示,31株菌存在至少一个所测的生物合成基因,NRPS 28 株,PKSⅠ17株,PKSⅡ21株,其中12株同时具有3种生物合成基因.结论：研究初步显示了双河洞系统蕴含丰富的放线菌资源,值得深入研究.