具有相同结构骨架的蛋白质环区肽库

摘要

在蛋白质结构数据库（ＰＤＢ）中存在许多源于相同结构骨架而又具有不同序列和构象的环区。通过搜索ＰＤＢ及结构相似蛋白家族数据库（ＦＳＳＰ），建立了一个具有１０１个环区家族的数据库，其中每个家族的环区均源于同一结构骨架。对各家族中环区的序列及结构进行了统计分析，此数据库可以用于同源结构预测中环区的建立和优化。