猫杯状病毒的分离鉴定及其ORF2基因的序列分析

摘要

为了解猫杯状病毒(feline calicivirus,FCV)在吉林省健康猫群中的流行情况,阐明其ORF2基因的遗传变异特性,本实验采用实时荧光定量PCR检测了采自临床健康宠物猫的口腔棉拭子。将阳性病料处理液接种F81细胞,分离病毒。以电镜观察、半巢式PCR等方法鉴定分离病毒;RT-PCR扩增出ORF2基因,进行克隆、序列测定,最后用生物学软件对基因序列进行分析。结果显示,成功分离出1株猫杯状病毒,暂命名为CH-JL1株。测序获得ORF2基因序列,全长为2007nt.序列分析显示,其与国内外参考毒株核苷酸序列同源性为68.8％-78.4％。核苷酸分子遗传衍化分析显示,CH-JL1株可能起源于UTCVM HI株。