北京油鸡喙畸形性状候选基因在畸形与正常喙组织中的差异表达分析

摘要

本文通过提取的鸡嚎组织总RNA经1%的琼脂糖凝胶电泳检测，可见总RNA 28 S和18S两条带整齐清晰、完整性好，且没有DNA污染条带及降解条带。经紫外分光光度计检测，OD260nmu001e/OD280nm值均在1.8-2.1之间，说明无蛋白质和DNA以及其它杂质污染，RNA纯度高。利用常规PCR对6个基因及p-actin基因进行扩增，目的片段大小与预期结果相符。标准曲线的相关系数均在0.994以上，扩增效率在0.9-1.1之间，定量结果准确可靠。7对引物在荧光定量PCR仪中的扩增效果良好，只有1个特异峰，为特异性产物，无引物二聚体及非特异性产物的形成。6个候选基因在畸形和正常鸡嚎组织中的相对表达量结果显示，BMP4,Claw keratin-like和LPL3个基因在畸形嚎中的表达量显均著高于正常嚎(P＜0.05) ; CK19,ALDH7A1和GLA3个基因在正常嚎中的表达量均显著高于畸形嚎。6个基因在畸形与正常鸡嚎组织中的表达量存在差异，且表达调控方向与前期DGE试验表现一致，说明前期筛选的结果具有较高的可靠性和准确性。同时，也进一步说明候选基因可能对北京油鸡嚎畸形性状有一定的调控作用，但主要调控机理还需要进一步研究与探索。