鸡一个新非编码长链RNA基因的克隆及表达分析

摘要

本文通过提取鸡卵巢RNA, 5'RACE及3'RACE引物设计以CR406381.1序列为材料进行试验研究，5'RACE扩增产物长度为1197bp,3'RACE扩增出现了4种不同的剪接体形式，分别为403,535,658,1310bp。将5'RACE及3'RACE序列结果进行校正后拼接，总共得到该新基因的4种不同的剪接体形式，长度分别为1782 ,1909,2032,2684bp，为mRNA样序列，含PolyA尾巴。利用生物信息学分析后发现该基因是位于鸡22号染色体上。在NCBI上进行BLAST搜索后发现该基因在哺乳动物上找不到同源序列，但发现在其它禽类如火鸡、斑胸草雀、鸭有同源基因，同源性比例分别为80%、70%、43%，基因序列在3‘端具有很高的保守性并为禽类所特有。但其同源性比例显著低于编码基因且其预测得到的开放阅读框在火鸡、斑胸草雀、鸭中不存在一致性，不符合编码基因的特征。目前越来越多的研究证实长链非编码RNA具有复杂的生物学功能，并与人类疾病的发生有密切的关系。本实验通过RACE扩增得到了鸡的一个新的基因，分析发现其为禽类所特有，为长链非编码RNA且存在较大的组织表达差异。后续实验将对该基因的生理学功能及意义进行更加深人的研究。